MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015508	AAC	2	6	27048	27053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715400
502	NC_015508	GCA	2	6	27054	27059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715400
503	NC_015508	A	6	6	27104	27109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015508	TAAAA	2	10	27131	27140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015508	A	7	7	27137	27143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015508	A	6	6	27173	27178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015508	CTGA	2	8	27263	27270	25 %	25 %	25 %	25 %	332715401
508	NC_015508	TGC	2	6	27331	27336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715401
509	NC_015508	CG	3	6	27370	27375	0 %	0 %	50 %	50 %	332715401
510	NC_015508	GGAC	2	8	27451	27458	25 %	0 %	50 %	25 %	332715401
511	NC_015508	GCG	2	6	27568	27573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715401
512	NC_015508	CGA	2	6	27784	27789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715401
513	NC_015508	GC	3	6	27842	27847	0 %	0 %	50 %	50 %	332715401
514	NC_015508	GCC	2	6	27902	27907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715401
515	NC_015508	TTA	2	6	27910	27915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715401
516	NC_015508	GAG	2	6	27941	27946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715401
517	NC_015508	TAT	2	6	27971	27976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715401
518	NC_015508	AG	3	6	28012	28017	50 %	0 %	50 %	0 %	332715401
519	NC_015508	TCCAT	2	10	28089	28098	20 %	40 %	0 %	40 %	332715401
520	NC_015508	CGA	2	6	28102	28107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715401
521	NC_015508	GA	3	6	28173	28178	50 %	0 %	50 %	0 %	332715401
522	NC_015508	AGCG	2	8	28223	28230	25 %	0 %	50 %	25 %	332715401
523	NC_015508	TGG	2	6	28322	28327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715401
524	NC_015508	CGG	2	6	28387	28392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715401
525	NC_015508	CTT	2	6	28537	28542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715401
526	NC_015508	AGC	2	6	28632	28637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715401
527	NC_015508	GTC	2	6	28682	28687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715401
528	NC_015508	GCG	2	6	28719	28724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715401
529	NC_015508	CCGGC	2	10	28864	28873	0 %	0 %	40 %	60 %	332715401
530	NC_015508	GTG	2	6	28896	28901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715401
531	NC_015508	TGAT	2	8	28917	28924	25 %	50 %	25 %	0 %	332715401
532	NC_015508	CTG	2	6	29057	29062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715401
533	NC_015508	AC	3	6	29127	29132	50 %	0 %	0 %	50 %	332715401
534	NC_015508	C	6	6	29213	29218	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
535	NC_015508	AGT	2	6	29234	29239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715402
536	NC_015508	GCG	2	6	29245	29250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715402
537	NC_015508	CGC	2	6	29369	29374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715402
538	NC_015508	CGC	2	6	29390	29395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715402
539	NC_015508	AGTCC	2	10	29465	29474	20 %	20 %	20 %	40 %	332715402
540	NC_015508	GAA	2	6	29507	29512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715402
541	NC_015508	TTG	2	6	29563	29568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715402
542	NC_015508	CCT	2	6	29809	29814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715402
543	NC_015508	GAA	2	6	29853	29858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715402
544	NC_015508	GGC	2	6	29860	29865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715402
545	NC_015508	GGGC	2	8	29892	29899	0 %	0 %	75 %	25 %	332715402
546	NC_015508	CGGA	2	8	29933	29940	25 %	0 %	50 %	25 %	332715402
547	NC_015508	TC	3	6	29955	29960	0 %	50 %	0 %	50 %	332715402
548	NC_015508	TTC	2	6	30169	30174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015508	TC	3	6	30253	30258	0 %	50 %	0 %	50 %	332715403
550	NC_015508	A	6	6	30303	30308	100 %	0 %	0 %	0 %	332715403
551	NC_015508	ACA	2	6	30329	30334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015508	T	6	6	30452	30457	0 %	100 %	0 %	0 %	332715404
553	NC_015508	GCA	2	6	30492	30497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715404
554	NC_015508	AAG	2	6	30532	30537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715404
555	NC_015508	TGG	2	6	30540	30545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715404
556	NC_015508	TTTG	2	8	30673	30680	0 %	75 %	25 %	0 %	332715404
557	NC_015508	ATG	2	6	30685	30690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715404
558	NC_015508	TCG	2	6	30744	30749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015508	GCA	2	6	30775	30780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015508	GAC	2	6	31055	31060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015508	GTC	2	6	31127	31132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015508	CGC	2	6	31164	31169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715405
563	NC_015508	TG	3	6	31175	31180	0 %	50 %	50 %	0 %	332715405
564	NC_015508	TCC	2	6	31301	31306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715405
565	NC_015508	AGC	2	6	31438	31443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715405
566	NC_015508	AATC	2	8	31446	31453	50 %	25 %	0 %	25 %	332715405
567	NC_015508	TAC	2	6	31458	31463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715405
568	NC_015508	CG	3	6	31469	31474	0 %	0 %	50 %	50 %	332715405
569	NC_015508	CGA	2	6	31476	31481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715405
570	NC_015508	TCC	2	6	31490	31495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715405
571	NC_015508	CGC	2	6	31522	31527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715405
572	NC_015508	TGA	2	6	31550	31555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715405
573	NC_015508	GAC	2	6	31628	31633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715406
574	NC_015508	GAC	2	6	31661	31666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715406
575	NC_015508	CGGA	2	8	31680	31687	25 %	0 %	50 %	25 %	332715406
576	NC_015508	TGC	2	6	31697	31702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715406
577	NC_015508	CGGCC	2	10	31723	31732	0 %	0 %	40 %	60 %	332715406
578	NC_015508	TGAC	2	8	31846	31853	25 %	25 %	25 %	25 %	332715406
579	NC_015508	TCC	2	6	31864	31869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715406
580	NC_015508	CTT	2	6	31884	31889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715406
581	NC_015508	TTC	2	6	31893	31898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715406
582	NC_015508	CGG	2	6	31946	31951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715406
583	NC_015508	TGC	2	6	32022	32027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715406
584	NC_015508	GCGCG	2	10	32051	32060	0 %	0 %	60 %	40 %	332715406
585	NC_015508	CAG	3	9	32117	32125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715406
586	NC_015508	C	7	7	32142	32148	0 %	0 %	0 %	100 %	332715407
587	NC_015508	CGC	2	6	32156	32161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715407
588	NC_015508	CAT	2	6	32177	32182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715407
589	NC_015508	TTGC	2	8	32256	32263	0 %	50 %	25 %	25 %	332715407
590	NC_015508	AGGT	2	8	32271	32278	25 %	25 %	50 %	0 %	332715407
591	NC_015508	GCG	2	6	32386	32391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715407
592	NC_015508	CGG	2	6	32415	32420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715407
593	NC_015508	CG	3	6	32424	32429	0 %	0 %	50 %	50 %	332715407
594	NC_015508	TGA	2	6	32449	32454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715407
595	NC_015508	GCC	2	6	32486	32491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715407
596	NC_015508	CGA	2	6	32497	32502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715407
597	NC_015508	GC	3	6	32520	32525	0 %	0 %	50 %	50 %	332715407
598	NC_015508	TTC	2	6	32567	32572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715407
599	NC_015508	CAC	2	6	32591	32596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715407
600	NC_015508	CAT	2	6	32627	32632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715407
601	NC_015508	ACA	2	6	32658	32663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715407
602	NC_015508	CTT	2	6	32713	32718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715407
603	NC_015508	GCCG	2	8	32726	32733	0 %	0 %	50 %	50 %	332715407
604	NC_015508	AACCG	2	10	32762	32771	40 %	0 %	20 %	40 %	332715407
605	NC_015508	TCG	2	6	32955	32960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715407
606	NC_015508	GCC	3	9	32972	32980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715407
607	NC_015508	TCA	2	6	32985	32990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715407
608	NC_015508	TCG	2	6	33051	33056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715407
609	NC_015508	CCG	2	6	33064	33069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715407
610	NC_015508	CGG	2	6	33101	33106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715407
611	NC_015508	CCG	2	6	33135	33140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715407
612	NC_015508	CCGA	2	8	33166	33173	25 %	0 %	25 %	50 %	332715407
613	NC_015508	GCC	2	6	33198	33203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715407
614	NC_015508	AG	3	6	33229	33234	50 %	0 %	50 %	0 %	332715407
615	NC_015508	GACC	2	8	33307	33314	25 %	0 %	25 %	50 %	332715407
616	NC_015508	CTCCG	2	10	33323	33332	0 %	20 %	20 %	60 %	332715407
617	NC_015508	CG	3	6	33379	33384	0 %	0 %	50 %	50 %	332715407
618	NC_015508	GCC	2	6	33417	33422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715408
619	NC_015508	GTCG	2	8	33450	33457	0 %	25 %	50 %	25 %	332715408
620	NC_015508	GCC	2	6	33474	33479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715408
621	NC_015508	ATCGC	2	10	33487	33496	20 %	20 %	20 %	40 %	332715408
622	NC_015508	TGA	2	6	33521	33526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715408
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624	NC_015508	ATT	2	6	33645	33650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715408
625	NC_015508	GTGG	2	8	33670	33677	0 %	25 %	75 %	0 %	332715408
626	NC_015508	GC	3	6	33751	33756	0 %	0 %	50 %	50 %	332715409
627	NC_015508	GCG	2	6	33798	33803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715409
628	NC_015508	GCA	2	6	33929	33934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715409
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630	NC_015508	CCG	2	6	34236	34241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715409
631	NC_015508	CGT	2	6	34251	34256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715409
632	NC_015508	AT	3	6	34305	34310	50 %	50 %	0 %	0 %	332715410
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664	NC_015508	GTT	2	6	36224	36229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715412
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759	NC_015508	CTT	2	6	41081	41086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715416
760	NC_015508	GTC	2	6	41100	41105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715416
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762	NC_015508	GGC	2	6	41269	41274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715416
763	NC_015508	CAG	2	6	41330	41335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715416
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766	NC_015508	CGG	2	6	41451	41456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715416
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771	NC_015508	GA	3	6	41696	41701	50 %	0 %	50 %	0 %	332715416
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778	NC_015508	CCT	2	6	42112	42117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
779	NC_015508	ACGTG	2	10	42136	42145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
780	NC_015508	ATG	3	9	42154	42162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
781	NC_015508	T	6	6	42190	42195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
782	NC_015508	GTCT	2	8	42247	42254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
783	NC_015508	A	6	6	42287	42292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
784	NC_015508	GAAA	2	8	42429	42436	75 %	0 %	25 %	0 %	332715417
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788	NC_015508	CTGCGC	2	12	42585	42596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332715417
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821	NC_015508	CGAA	2	8	43944	43951	50 %	0 %	25 %	25 %	332715418
822	NC_015508	TG	3	6	43960	43965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
823	NC_015508	CTG	2	6	44066	44071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715419
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